一、生长环境不同：

1、古细菌（古核细胞），常生活于热泉水、缺氧湖底、盐水湖等极端环境中的细菌。

2、细菌对低温的耐受性较强，大多数细菌在液态空气（-190℃）或液态氧（-252℃）下可保存多年。高温对细菌有明显的杀伤作用，大多数无芽孢菌在100℃煮沸时立即死亡，而有芽孢的细菌对高热有抗力，如炭疽芽孢可耐受煮沸5-15分钟，湿热灭菌比干热效果强，因为湿热灭菌渗透性大。

二、性质不同：

1、古细菌具有一些独特的生化性质，如膜脂由醚键而不是酯键连接，其营养方式亦不同于常规生物，如硫氧化等。古核细胞遗传的信息量较小，是世界上最早的生物。

2、细菌，生物的主要类群之一，属于细菌域。也是所有生物中数量最多的一类，据估计，其总数约有5×10^30个。细菌的形状相当多样，主要有球状、杆状，以及螺旋状。